1912年(民國元年)，革命黨人在惠遠(yuǎn)起義，成立中華民國軍政府新伊大都督府。1913年(民國2年)，裁伊犁府，綏定縣屬伊塔道。1914年(民國3年)撤霍爾果斯分防廳，從綏定縣析置霍爾果斯縣(中華人民共和國成立后稱霍城縣)，縣府駐拱宸城。1917年(民國6年)，伊塔分道，綏定、霍爾果斯屬伊犁道。
中華人民共和國成立后，綏定縣、霍城縣屬于伊犁地區(qū)。1965年11月國務(wù)院將綏定縣改名水定縣，1966年1月國務(wù)院撤銷水定縣，將水定縣行政區(qū)域劃給霍城縣，縣人民政府駐水定鎮(zhèn)。1990年霍城縣轄2鎮(zhèn)、7鄉(xiāng)，6個國營農(nóng)牧場。縣境內(nèi)駐有新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)農(nóng)業(yè)第四師(兵團(tuán)農(nóng)四師)6個團(tuán)場、1個工業(yè)企業(yè)和霍爾果斯河灌溉管理處；駐有伊犁糖廠、自治區(qū)林業(yè)廳天山西部林業(yè)局二臺林場。駐有霍爾果斯口岸和口岸相關(guān)部門。2010年轄5鎮(zhèn)、5鄉(xiāng)、3個農(nóng)牧場，駐有兵團(tuán)農(nóng)四師6個團(tuán)場、1個工業(yè)企業(yè)和霍爾果斯河灌溉管理處；駐有四方糖業(yè)公司、自治區(qū)林業(yè)廳天山西部林業(yè)局霍城林場。駐有霍爾果斯口岸和口岸相關(guān)部門。2014年6月，國務(wù)院同意設(shè)立縣級霍爾果斯市，將原霍城縣伊車嘎善錫伯鄉(xiāng)、莫乎爾牧場、新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)農(nóng)四師61團(tuán)和62團(tuán)、霍爾果斯口岸劃歸霍爾果斯市。2020年6月30日，自治區(qū)人民政府同意霍城縣撤銷蘭干鄉(xiāng)建制，設(shè)立蘭干鎮(zhèn)，2023年11月3日自治區(qū)人民政府同意霍城縣轍銷大西溝鄉(xiāng)建制，設(shè)立大西溝鎮(zhèn)，行政區(qū)域界線、政府駐地及隸屬關(guān)系不變。2023年，霍城縣轄7鎮(zhèn)、2鄉(xiāng)、1個良種繁育中心，以及霍爾果斯經(jīng)濟(jì)開發(fā)區(qū)清水河配套產(chǎn)業(yè)園(清水河經(jīng)濟(jì)開發(fā)區(qū)）、伊犁國家農(nóng)業(yè)科技示范園2個國家級園區(qū)。
